公司两年未签劳动协议，应支付二倍工资作为赔偿。依据《劳动合同法》，用工两年未签书面合同，视为已订立无固定期限合同，不及时处理可能导致公司面临法律诉讼和巨额赔偿。
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公司两年未签劳动协议，常见处理方式为协商或诉讼。应先尝试与公司协商，要求签订无固定期限合同并支付赔偿；协商不成时，可向劳动仲裁委提起仲裁或诉讼。
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公司未签劳动协议两年，应赔偿。操作：1. 收集证据，如工资单、考勤记录等；2. 与公司协商，要求签合同并赔偿；3. 协商无果，向劳动仲裁委申请仲裁；4. 如仲裁不满，可向法院提起诉讼。